Brief Information of the Compound and Protein
Compound Name
 Compound Info 
N'-hydroxy-N-phenyloctanediamide
    Show/Hide
 PubChem ID
CID: 5311
SID: 14823867
Canonical SMILES
ONC(=O)CCCCCCC(=O)Nc1ccccc1
    Show/Hide
Compound Formula C14H20N2O3
Compound Structure
Protein Name
 Protein Info 
Histone deacetylase 1
Protein Classification
Epigenetic regulator
>
Eraser
>
Histone deacetylase
>
HDAC class I
Uniprot ID
Q13547
Gene Name
HDAC1
Table of Molecular Bioactivities Related to the Compound and Protein
Cell-based Assay
Cell Line ID Cell Line Name Cell Line Organism
CL000023 BTI-Tn-5B1-4
 Cell Line Info 
Trichoplusia ni (Cabbage looper)  7
1
IC50 = 90 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 93.34 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 100 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 120 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 180 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 195 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 210.98 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000034 Caco-2
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 119 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000163 COLO 205
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 2200 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000025 HEK-293T
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 600 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000006 HEK293
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  7
1
IC50 = 13 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 20 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 21 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 30 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 33 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 122 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 240 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000017 HeLa
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  3
1
IC50 = 20 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 38 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 119 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000162 HeLa S3
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 33 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000012 Sf21
 Cell Line Info 
Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  1
1
IC50 = 306 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000013 Sf9
 Cell Line Info 
Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  25
1
IC50 = 5.5 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 9.1 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 10 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 11 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 13 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 19 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 23 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
8
IC50 = 25 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
9
IC50 = 26 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
10
IC50 = 31 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
11
IC50 = 32 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
12
IC50 = 33 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
13
IC50 = 35 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
14
IC50 = 44 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
15
IC50 = 45 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
16
IC50 = 50.12 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
17
IC50 = 63.5 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
18
IC50 = 79 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
19
IC50 = 80 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
20
IC50 = 81 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
21
IC50 = 85 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
22
IC50 = 99 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
23
IC50 = 101 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
24
IC50 = 110 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
25
IC50 = 111 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
Biochemical Assays
1 IC50 = 4 nM
2 IC50 = 5 nM
3 IC50 = 5.2 nM
4 IC50 = 7 nM
5 IC50 = 8.9 nM
6 IC50 = 9 nM
7 IC50 = 9.7 nM
8 IC50 = 10 nM
9 IC50 = 10.68 nM
10 IC50 = 10.8 nM
11 IC50 = 11 nM
12 IC50 = 11.11 nM
13 IC50 = 11.34 nM
14 IC50 = 12 nM
15 IC50 = 13 nM
16 IC50 = 14 nM
17 IC50 = 14.15 nM
18 IC50 = 14.3 nM
19 IC50 = 14.4 nM
20 IC50 = 14.6 nM
21 IC50 = 15 nM
22 IC50 = 16 nM
23 IC50 = 17 nM
24 IC50 = 17.39 nM
25 IC50 = 18 nM
26 IC50 = 20 nM
27 IC50 = 20.9 nM
28 IC50 = 21 nM
29 IC50 = 22.37 nM
30 IC50 = 22.4 nM
31 IC50 = 22.7 nM
32 IC50 = 23 nM
33 IC50 = 25 nM
34 IC50 = 25.8 nM
35 IC50 = 27 nM
36 IC50 = 29 nM
37 IC50 = 30 nM
38 IC50 = 31 nM
39 IC50 = 33 nM
40 IC50 = 34 nM
41 IC50 = 34.6 nM
42 IC50 = 37.7 nM
43 IC50 = 38 nM
44 IC50 = 39.8 nM
45 IC50 = 39.91 nM
46 IC50 = 40 nM
47 IC50 = 41 nM
48 IC50 = 42 nM
49 IC50 = 42.5 nM
50 IC50 = 42.82 nM
51 IC50 = 43 nM
52 IC50 = 43.76 nM
53 IC50 = 43.9 nM
54 IC50 = 44 nM
55 IC50 = 45 nM
56 IC50 = 45.5 nM
57 IC50 = 46 nM
58 IC50 = 47.4 nM
59 IC50 = 47.95 nM
60 IC50 = 48 nM
61 IC50 = 49 nM
62 IC50 = 51.75 nM
63 IC50 = 52 nM
64 IC50 = 53.78 nM
65 IC50 = 54.6 nM
66 IC50 = 56 nM
67 IC50 = 59 nM
68 IC50 = 60.7 nM
69 IC50 = 61 nM
70 IC50 = 62.9 nM
71 IC50 = 65 nM
72 IC50 = 65.2 nM
73 IC50 = 65.4 nM
74 IC50 = 68 nM
75 IC50 = 68.1 nM
76 IC50 = 69 nM
77 IC50 = 71.8 nM
78 IC50 = 73 nM
79 IC50 = 75 nM
80 IC50 = 76 nM
81 IC50 = 77 nM
82 IC50 = 82 nM
83 IC50 = 87.4 nM
84 IC50 = 87.9 nM
85 IC50 = 88 nM
86 IC50 = 88.5 nM
87 IC50 = 89 nM
88 IC50 = 90 nM
89 IC50 = 91 nM
90 IC50 = 93.34 nM
91 IC50 = 93.6 nM
92 IC50 = 96 nM
93 IC50 = 101.98 nM
94 IC50 = 106 nM
95 IC50 = 110 nM
96 IC50 = 117 nM
97 IC50 = 119 nM
98 IC50 = 119.5 nM
99 IC50 = 120 nM
100 IC50 = 121 nM
101 IC50 = 131 nM
102 IC50 = 131.5 nM
103 IC50 = 136 nM
104 IC50 = 138.5 nM
105 IC50 = 140 nM
106 IC50 = 142 nM
107 IC50 = 150 nM
108 IC50 = 162.7 nM
109 IC50 = 170 nM
110 IC50 = 180 nM
111 IC50 = 180.3 nM
112 IC50 = 190 nM
113 IC50 = 200 nM
114 IC50 = 203.06 nM
115 IC50 = 219.3 nM
116 IC50 = 220 nM
117 IC50 = 236 nM
118 IC50 = 240 nM
119 IC50 = 258 nM
120 IC50 = 260 nM
121 IC50 = 270 nM
122 IC50 = 290 nM
123 IC50 = 300 nM
124 IC50 = 306 nM
125 IC50 = 310 nM
126 IC50 = 320 nM
127 IC50 = 350 nM
128 IC50 = 480 nM
129 IC50 = 600 nM
130 IC50 = 775 nM
131 Kd = 40 nM
132 Ki = 1.3 nM
133 Ki = 8 nM
134 Ki = 10 nM
135 Ki = 12 nM
136 Ki = 48 nM
137 Ki = 60 nM
138 Ki = 63 nM