Brief Information of the Compound and Protein
Compound Name
 Compound Info 
N'-hydroxy-N-phenyloctanediamide
    Show/Hide
 PubChem ID
CID: 5311
SID: 14823867
Canonical SMILES
ONC(=O)CCCCCCC(=O)Nc1ccccc1
    Show/Hide
Compound Formula C14H20N2O3
Compound Structure
Protein Name
 Protein Info 
Histone deacetylase 6
Protein Classification
Epigenetic regulator
>
Eraser
>
Histone deacetylase
>
HDAC class IIb
Uniprot ID
Q9UBN7
Gene Name
HDAC6
Table of Molecular Bioactivities Related to the Compound and Protein
Cell-based Assay
Cell Line ID Cell Line Name Cell Line Organism
CL000068 A-549
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  2
1
EC50 = 1000 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
EC50 = 1030 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000072 A2780
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
EC50 = 399.25 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000023 BTI-Tn-5B1-4
 Cell Line Info 
Trichoplusia ni (Cabbage looper)  7
1
IC50 = 70 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 78.98 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 90 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 105.1 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 120 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 130 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 179.62 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000006 HEK293
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  6
1
IC50 = 19 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 25 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 43 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 52 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 140 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 241 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000017 HeLa
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  2
1
EC50 = 21.7 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 27 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000162 HeLa S3
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 33 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000083 MCF-7
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
EC50 = 430 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000013 Sf9
 Cell Line Info 
Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  23
1
IC50 = 2.8 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 5 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 5.8 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 12 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 12.6 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 13 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 20 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
8
IC50 = 21 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
9
IC50 = 23 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
10
IC50 = 24.2 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
11
IC50 = 31 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
12
IC50 = 34.3 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
13
IC50 = 42 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
14
IC50 = 50 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
15
IC50 = 53 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
16
IC50 = 55 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
17
IC50 = 59.3 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
18
IC50 = 60 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
19
IC50 = 83 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
20
IC50 = 102 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
21
IC50 = 108 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
22
IC50 = 860 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
23
Ki < 35 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
Biochemical Assays
1 IC50 = 1.4 nM
2 IC50 = 2 nM
3 IC50 = 2.71 nM
4 IC50 = 3.9 nM
5 IC50 = 4.87 nM
6 IC50 = 5 nM
7 IC50 = 6.7 nM
8 IC50 = 6.9 nM
9 IC50 = 7.25 nM
10 IC50 = 7.7 nM
11 IC50 = 7.76 nM
12 IC50 = 8.8 nM
13 IC50 = 9 nM
14 IC50 = 9.1 nM
15 IC50 = 9.2 nM
16 IC50 = 9.3 nM
17 IC50 = 9.4 nM
18 IC50 = 10 nM
19 IC50 = 10.8 nM
20 IC50 = 11 nM
21 IC50 = 12 nM
22 IC50 = 13 nM
23 IC50 = 14 nM
24 IC50 = 14.5 nM
25 IC50 = 15 nM
26 IC50 = 15.1 nM
27 IC50 = 16.3 nM
28 IC50 = 17 nM
29 IC50 = 17.2 nM
30 IC50 = 17.4 nM
31 IC50 = 18 nM
32 IC50 = 18.5 nM
33 IC50 = 19 nM
34 IC50 = 19.4 nM
35 IC50 = 19.8 nM
36 IC50 = 20 nM
37 IC50 = 20.2 nM
38 IC50 = 21 nM
39 IC50 = 21.6 nM
40 IC50 = 23 nM
41 IC50 = 24 nM
42 IC50 = 24.25 nM
43 IC50 = 24.4 nM
44 IC50 = 25 nM
45 IC50 = 25.6 nM
46 IC50 = 26 nM
47 IC50 = 26.9 nM
48 IC50 = 27 nM
49 IC50 = 28 nM
50 IC50 = 28.6 nM
51 IC50 = 28.9 nM
52 IC50 = 29 nM
53 IC50 = 29.7 nM
54 IC50 = 30 nM
55 IC50 = 31 nM
56 IC50 = 32 nM
57 IC50 = 33 nM
58 IC50 = 33.1 nM
59 IC50 = 34 nM
60 IC50 = 35 nM
61 IC50 = 36 nM
62 IC50 = 38 nM
63 IC50 = 38.9 nM
64 IC50 = 39 nM
65 IC50 = 39.9 nM
66 IC50 = 40 nM
67 IC50 = 41.9 nM
68 IC50 = 42 nM
69 IC50 = 43 nM
70 IC50 = 47 nM
71 IC50 = 49 nM
72 IC50 = 50 nM
73 IC50 = 51 nM
74 IC50 = 52 nM
75 IC50 = 53 nM
76 IC50 = 54 nM
77 IC50 = 57.3 nM
78 IC50 = 60 nM
79 IC50 = 63 nM
80 IC50 = 65 nM
81 IC50 = 70 nM
82 IC50 = 70.83 nM
83 IC50 = 71 nM
84 IC50 = 72.34 nM
85 IC50 = 74 nM
86 IC50 = 75.9 nM
87 IC50 = 78.3 nM
88 IC50 = 78.98 nM
89 IC50 = 82 nM
90 IC50 = 85 nM
91 IC50 = 85.5 nM
92 IC50 = 88 nM
93 IC50 = 90 nM
94 IC50 = 91 nM
95 IC50 = 96 nM
96 IC50 = 98 nM
97 IC50 = 100 nM
98 IC50 = 109 nM
99 IC50 = 110 nM
100 IC50 = 110.6 nM
101 IC50 = 118 nM
102 IC50 = 144 nM
103 IC50 = 160 nM
104 IC50 = 169.5 nM
105 IC50 = 195 nM
106 IC50 = 196 nM
107 IC50 = 200 nM
108 IC50 = 202.11 nM
109 IC50 = 210 nM
110 IC50 = 226 nM
111 IC50 = 250 nM
112 IC50 = 340 nM
113 IC50 = 350 nM
114 IC50 = 400 nM
115 IC50 = 800 nM
116 IC50 = 5600 nM
117 Kd = 300 nM
118 Ki = 1 nM
119 Ki = 1.6 nM
120 Ki = 18 nM
121 Ki = 20 nM
122 Ki = 21 nM
123 Ki = 22 nM
124 Ki = 29 nM
125 Ki = 126 nM