Brief Information of the Compound and Protein
Compound Name
N'-hydroxy-N-phenyloctanediamide
    Show/Hide
PubChem ID
CID: 5311
SID: 14823867
Canonical SMILES
ONC(=O)CCCCCCC(=O)Nc1ccccc1
    Show/Hide
Compound Formula C14H20N2O3
Compound Structure
Protein Name
Histone deacetylase 3
Protein Classification
Epigenetic regulator
>
Eraser
>
Histone deacetylase
>
HDAC class I
Uniprot ID
O15379
Gene Name
HDAC3
Table of Molecular Bioactivities Related to the Compound and Protein
Cell-based Assay
Cell Line ID Cell Line Name Cell Line Organism
CL000023 BTI-Tn-5B1-4 Trichoplusia ni (Cabbage looper)  7
1
IC50 = 110 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 120 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 140 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 158.17 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 170 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 181.05 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 232.08 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000034 Caco-2 Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 147 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000006 HEK293 Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 57 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000131 HEK293-F Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 29 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000017 HeLa Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 106 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000162 HeLa S3 Homo sapiens (Human)  1
1
IC50 = 20 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000012 Sf21 Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  1
1
IC50 = 37 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000013 Sf9 Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  4
1
IC50 = 6.57 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 6.8 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 20 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 29.7 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
Biochemical Assays
1 IC50 = 1.4 nM
2 IC50 = 3 nM
3 IC50 = 4 nM
4 IC50 = 12.6 nM
5 IC50 = 17 nM
6 IC50 = 18 nM
7 IC50 = 18.6 nM
8 IC50 = 19.1 nM
9 IC50 = 20 nM
10 IC50 = 21 nM
11 IC50 = 21.8 nM
12 IC50 = 26 nM
13 IC50 = 28 nM
14 IC50 = 28.1 nM
15 IC50 = 29 nM
16 IC50 = 29.5 nM
17 IC50 = 30 nM
18 IC50 = 31 nM
19 IC50 = 33 nM
20 IC50 = 33.1 nM
21 IC50 = 34 nM
22 IC50 = 35 nM
23 IC50 = 37 nM
24 IC50 = 38 nM
25 IC50 = 39.6 nM
26 IC50 = 40 nM
27 IC50 = 41 nM
28 IC50 = 45 nM
29 IC50 = 46 nM
30 IC50 = 48 nM
31 IC50 = 49 nM
32 IC50 = 50 nM
33 IC50 = 51 nM
34 IC50 = 52.99 nM
35 IC50 = 55 nM
36 IC50 = 56 nM
37 IC50 = 56.56 nM
38 IC50 = 56.8 nM
39 IC50 = 57 nM
40 IC50 = 62 nM
41 IC50 = 65.18 nM
42 IC50 = 67 nM
43 IC50 = 67.1 nM
44 IC50 = 70 nM
45 IC50 = 74.4 nM
46 IC50 = 81.76 nM
47 IC50 = 87.95 nM
48 IC50 = 90 nM
49 IC50 = 90.1 nM
50 IC50 = 100 nM
51 IC50 = 106 nM
52 IC50 = 107 nM
53 IC50 = 107.2 nM
54 IC50 = 108 nM
55 IC50 = 110 nM
56 IC50 = 126 nM
57 IC50 = 130 nM
58 IC50 = 132 nM
59 IC50 = 136 nM
60 IC50 = 140 nM
61 IC50 = 144.7 nM
62 IC50 = 146 nM
63 IC50 = 150 nM
64 IC50 = 153 nM
65 IC50 = 158.17 nM
66 IC50 = 170 nM
67 IC50 = 182 nM
68 IC50 = 200 nM
69 IC50 = 250 nM
70 IC50 = 261 nM
71 IC50 = 323 nM
72 IC50 = 350 nM
73 IC50 = 460 nM
74 IC50 = 517 nM
75 Ki = 5 nM
76 Ki = 12 nM
77 Ki = 29 nM
78 Ki = 36 nM