Brief Information of the Compound and Protein
Compound Name
 Compound Info 
CHEBI:46024
    Show/Hide
 PubChem ID
CID: 444732
SID: 12013760
Canonical SMILES
C[C@H](\C=C(/C)\C=C\C(=O)NO)C(=O)c1ccc(cc1)N(C)C
    Show/Hide
Compound Formula C17H22N2O3
Compound Structure
Protein Name
 Protein Info 
Histone deacetylase 1
Protein Classification
Epigenetic regulator
>
Eraser
>
Histone deacetylase
>
HDAC class I
Uniprot ID
Q13547
Gene Name
HDAC1
Table of Molecular Bioactivities Related to the Compound and Protein
Cell-based Assay
Cell Line ID Cell Line Name Cell Line Organism
CL000025 HEK-293T
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  4
1
IC50 = 1.9 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 19 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 36.6 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 190 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000035 NIH 3T3
 Cell Line Info 
Mus musculus (Mouse)  1
1
IC50 = 21 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000012 Sf21
 Cell Line Info 
Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  8
1
IC50 = 6.96 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 9 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 9.4 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 9.59 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 = 15.8 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 17.9 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
IC50 = 32 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
8
Ki = 0.64 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000013 Sf9
 Cell Line Info 
Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  5
1
IC50 = 0.681 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 1.5 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 5 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 9 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 < 10 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000203 T24
 Cell Line Info 
Homo sapiens (Human)  1
1
EC50 = 1000 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
Biochemical Assays
1 IC50 = 0.15 nM
2 IC50 = 2 nM
3 IC50 = 2.14 nM
4 IC50 = 2.2 nM
5 IC50 = 2.3 nM
6 IC50 = 3 nM
7 IC50 = 3.3 nM
8 IC50 = 3.511 nM
9 IC50 = 4 nM
10 IC50 = 4.3 nM
11 IC50 = 4.9 nM
12 IC50 = 5 nM
13 IC50 = 5.6 nM
14 IC50 = 6 nM
15 IC50 = 6.22 nM
16 IC50 = 6.7 nM
17 IC50 = 6.89 nM
18 IC50 = 6.9 nM
19 IC50 = 7 nM
20 IC50 = 7.12 nM
21 IC50 = 7.4 nM
22 IC50 = 7.7 nM
23 IC50 = 8.22 nM
24 IC50 = 8.5 nM
25 IC50 = 9.2 nM
26 IC50 = 9.9 nM
27 IC50 = 10 nM
28 IC50 = 10.9 nM
29 IC50 = 12 nM
30 IC50 = 12.44 nM
31 IC50 = 12.5 nM
32 IC50 = 15 nM
33 IC50 = 16 nM
34 IC50 = 20 nM
35 IC50 = 21 nM
36 IC50 = 23 nM
37 IC50 = 24.9 nM
38 IC50 = 26 nM
39 IC50 = 62 nM
40 IC50 = 4740 nM
41 IC50 > 25000 nM
42 Ki = 0.2 nM
43 Ki = 0.23 nM
44 Ki = 0.87 nM