Brief Information of the Compound and Protein
Compound Name
CHEBI:46024
    Show/Hide
PubChem ID
CID: 444732
SID: 12013760
Canonical SMILES
C[C@H](\C=C(/C)\C=C\C(=O)NO)C(=O)c1ccc(cc1)N(C)C
    Show/Hide
Compound Formula C17H22N2O3
Compound Structure
Protein Name
Histone deacetylase 6
Protein Classification
Epigenetic regulator
>
Eraser
>
Histone deacetylase
>
HDAC class IIb
Uniprot ID
Q9UBN7
Gene Name
HDAC6
Table of Molecular Bioactivities Related to the Compound and Protein
Cell-based Assay
Cell Line ID Cell Line Name Cell Line Organism
CL000025 HEK-293T Homo sapiens (Human)  2
1
IC50 = 83.3 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 280 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000017 HeLa Homo sapiens (Human)  1
1
EC50 = 5.2 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
CL000013 Sf9 Spodoptera frugiperda (Fall armyworm)  7
1
IC50 = 0.9 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
2
IC50 = 1.2 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
3
IC50 = 2 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
4
IC50 = 2.11 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
5
IC50 < 10 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
6
IC50 = 16.8 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
7
Ki = 0.58 nM
   TI
   LI
   LO
   TS
Biochemical Assays
1 IC50 = 0.4 nM
2 IC50 = 0.419 nM
3 IC50 = 0.42 nM
4 IC50 = 0.8 nM
5 IC50 = 1 nM
6 IC50 = 1.07 nM
7 IC50 = 1.1 nM
8 IC50 = 1.4 nM
9 IC50 = 1.5 nM
10 IC50 = 1.56 nM
11 IC50 = 1.6 nM
12 IC50 = 1.94 nM
13 IC50 = 2 nM
14 IC50 = 2.09 nM
15 IC50 = 2.3 nM
16 IC50 = 2.31 nM
17 IC50 = 2.6 nM
18 IC50 = 3.13 nM
19 IC50 = 3.49 nM
20 IC50 = 3.55 nM
21 IC50 = 4.53 nM
22 IC50 = 5 nM
23 IC50 = 6 nM
24 IC50 = 8.2 nM
25 IC50 = 8.6 nM
26 IC50 = 8.922 nM
27 IC50 = 9 nM
28 IC50 = 9.3 nM
29 IC50 = 11.1 nM
30 IC50 = 13 nM
31 IC50 = 15 nM
32 IC50 = 16.8 nM
33 IC50 = 20 nM
34 IC50 = 38 nM
35 IC50 = 51 nM
36 IC50 = 53 nM
37 IC50 = 56 nM
38 IC50 = 65 nM
39 IC50 = 81 nM
40 IC50 = 91 nM
41 IC50 = 600 nM
42 IC50 = 1210 nM
43 IC50 = 3600 nM
44 Ki = 0.13 nM
45 Ki = 0.99 nM
46 Ki = 1 nM
47 Ki = 3.02 nM